攝護腺結石患者大多無症狀，只有與其他病變並存時才出現症狀，如慢性攝護腺炎、攝護腺增生症或尿道狹窄等疾病的症狀。許多病人往往在對相關疾病做檢查時才發現有攝護腺結石的存在。

攝護腺結石合並慢性攝護腺炎，可表現為下腰部、會陰部、陰囊、陰莖或肛門等部位的疼痛，排便時肛門疼痛加重，尿道外口可有分泌物，會陰部受壓時疼痛加重；伴有後尿道炎時可有尿頻、尿急和尿痛，有時有血尿，尤其是終末血尿，性功能紊亂等。形成膿腫時可有發熱、尿瀦留和會陰直腸部疼痛，排便時加重，有體溫升高、尿瀦留等症狀。

攝護腺結石合並攝護腺增生或尿道狹窄時，可表現為排尿困難，尿頻，尿線細而無力，甚至尿滴瀝等症狀。由於患攝護腺結石的病人年齡多在40歲以上，以上情況頗為常見。小的結石有時會自行排出，或在攝護腺按摩時排出小結石。