1、慢性尿道炎或膀胱炎：其臨床表現與慢性攝護腺炎類似，但作攝護腺檢查可無異常發現。

2、攝護腺痛：無實質性病變，表現為會陰部和恥骨上區疼痛和壓痛，有排尿障礙等尿路表現。攝護腺觸診正常，攝護腺液鏡檢正常，攝護腺液及尿液培養無細菌。

3、肉芽腫性攝護腺炎，盡管症狀、直腸指檢易與慢性攝護腺炎混淆，但前者進展快，可迅速發生尿瀦留，短期內硬結生長較快。需作攝護腺活體組織檢查鑒別，組織學檢查表現為肉芽腫性反應。

4、卡他性攝護腺炎或攝護腺病（亦稱非細菌性攝護腺炎）臨床症狀與慢性攝護腺炎很難區別。會陰部疼痛不適，有排尿及性功能障礙等表現。攝護腺液檢查有多量卵磷脂小體，白細胞增多，但塗片及細菌培養均無細菌生長。

5、攝護腺溢液（又稱無菌性攝護腺炎、攝護腺漏或慢性攝護腺充血）：大、小便終末有乳白色分泌物從尿道流出，常合並精神症狀。但直腸指檢、攝護腺液鏡檢均正常，細菌學檢查陰性。

6、攝護腺癌：晚期可出現尿路症狀。直腸指檢發現攝護腺有堅硬的腫塊，表面高低不平。攝護腺液塗片、穿刺活檢均可發現癌細胞。

7、攝護腺結石：出現腰骶部、會陰部疼痛及性功能紊亂陽痿

、

早洩等症狀。直腸指檢可捫及攝護腺有結石摩擦感，骨盆X線平片有陽性結石陰影，可資鑒別。

8、攝護腺結核。症狀與攝護腺炎相似，但有結核病史。直腸指檢攝護腺呈不規則結節狀，附睪腫大變硬，輸精管有串珠狀硬結。攝護腺液結核桿菌直接塗片或結核桿菌培養可以找l到結核桿菌，攝護腺活體組織檢查可見結核結節或幹酶樣壞死。