陰莖勃起障礙分器質性和功能性兩類，陰莖組織由於某種原因受到實際損傷而發生的勃起障礙就可以認為是器質性的。比如陰莖血管先天性異常或阻塞，神經系統疾病，均可導致陰莖勃起障礙。

血管先天性異常或阻塞

如動脈硬化，動脈炎，陰莖異常勃起，局部血管血栓形成，栓塞，血管瘤；單側或雙側陰莖動脈主支或分支發育不全及分佈異常，血管叢異常，動靜脈交通支異常，海綿體血流排放系統的異常均可導致器質性勃起障礙（可占60%~70%）。

神經系統患病因素

帕金森氏病，顳葉病變或損傷、大腦癱瘓、頭顱損傷、重症肌無力、脊髓和中樞部位腫瘤、脊髓損傷合並截癱（睪丸血管去神經作用）、多發性硬化症、脊髓癆、脊髓裂、亞急性聯合性退化、側索硬化致肌肉萎縮、交感神經節切除術、腹膜後淋巴結清掃術、周圍神經炎等都可造成支配陰莖勃起的神經發生病變，導致器質性勃起障礙。

特別提示：身體其他器質性的疾病所導致患者性生活耐力缺乏，陰莖勃起時間較短，或勃起不堅，甚或不能勃起，也可認為發生有器質性勃起障礙。比如心肌梗死後，肺氣腫或肺功能不全，貧血，全身疾患（感染、營養），代謝障礙（腎、肝衰竭）等都可導致患者性生活耐力大減，勃起功能障礙。