睪丸微痛可能因為睪丸炎症引起，或者睪丸損傷造成。細菌通過尿路感染逆行到附睪以及睪丸而引起感染也可造成睪丸疼痛。如果是損傷引起睪丸疼痛，則疼痛部位有淤血，在運動劇烈的時候疼痛感加重，並且使得提睪肌收縮強烈。睪丸突然被扭轉也可造成疼痛。睪丸微痛時男性性欲可降低。

睪丸微痛常在重體力勞動後發生，如舉扛重物後等，也可以在較強烈的性興奮後出現。除此之外，經尿道器械操作所致的損傷可造成附睪炎，攝護腺摘除術後也可並發附睪炎。

因尿道留置導管和尿道內器械檢查誘發攝護腺感染，及伴發急性附睪炎也可造成睪丸微痛。無菌尿返流進輸精管可造成化學性附睪炎都能引發睪丸疼痛。

急性附睪炎常繼發於攝護腺炎，陰囊內睪丸疼痛常突然發生，可沿精索放射至腹股溝區及腰骶部，疼痛通常較重，觸壓時疼痛明顯加劇。同時，腫脹進展較快，可在3~4小時內使附睪體積增大一倍，體溫可達40℃左右，尿道內可有分泌物出現，此時可伴有膀胱炎，尿液混濁。

臨床上附睪炎患者會出現睪丸隱痛的症狀，疼痛並向腹股溝放射，有明顯的下墜感覺，還同時有高熱、惡心、嘔吐、白細胞升高等，同時睪丸腫大、隱痛非常明顯，陰囊皮膚紅腫。檢查時附睪常有不同程度的增大變硬。有輕度壓痛，同側輸精管可增粗。

睪丸微痛對患者危害大，能夠使得患者生育能力喪失，還可誘發精索靜脈曲張、攝護腺炎等疾病。睪丸輕微疼痛可懷疑為惡性腫瘤。這種疼痛如果是因為炎症長期刺激引起，則可在男性射精時疼痛加重，嚴重影響到夫妻生活質量。