也有一部分正如上述找不到細菌，病因含糊，即上述的慢性非細菌性攝護腺炎。急性攝護腺炎的症狀可謂是十分典型，表現為攝護腺部位，會陰部位下墜樣疼痛，連、腰背部、大腿上端、下腹部都會出現隱痛。而且還會出現排尿異常，由於攝護腺明顯充血與腫脹，甚至可以產生排尿困難現象。

隨著這些局部症狀出現的同時，病人往往會出現高熱與畏寒，體溫有時竟可高達39-40℃，伴隨陣陣發寒，人也會發抖，精神不振，關節酸痛、周身乏力、惡心嘔吐等，如果此時作一次肛門直腸指檢，隔著腸壁可摸到前過緊鄰的攝護腺腫得厲害，而且有壓痛。

慢性攝護腺炎，無論細菌性抑或非細菌性，也有相當數量的病人表現有慢性狀況的典型症狀，例如排尿結束後總有種滴瀝不清的感覺，或者真的會滴瀝出一些尿液;尿道口有“滴白”現象，也就是經常在早晨起來發現尿道口有稀薄水樣分泌或較厚稠的乳白色粘液粘著，或者是大便及排尿結束後尿道口有白色液體滴出;經常會陰部不適或外生殖器及肛門部脹痛等。

在慢性攝護腺炎病人中，也確有一部分人症狀不典型，表現十分模糊，會出現一些莫名其妙似乎與攝護腺炎毫不相幹的症狀，到頭來查明果真還是攝護腺炎。例如不明原因的倦怠、性欲減退、、射精疼痛、陽痿、血精、血尿、尿頻等。更莫名其妙的是，有些攝護腺炎病人最初並無相應的攝護腺方面症狀，而是出現、肛膜炎、結膜炎、肌炎、關節炎等疾病，這主要是侵犯攝護腺的細菌產生的毒素在作怪的緣故，由此可見，慢性攝護腺炎有症狀模糊的一面，應該加以重視。至於慢性攝護腺炎作肛門直腸指檢，攝護腺局部腫脹並不明顯，也無壓痛，與急例相比可謂徑渭分明。